ФГУП «Нацрыбресурс» находится в ведении Федерального агентства по рыболовству (www.fishcom.ru). Полномочия собственника имущества предприятия осуществляет Федеральное агентство по управлению государственным имуществом (www.rosim.ru) и Федеральное агентство по рыболовству.

Предприятие принимает участие в реализации Федеральной целевой программы «Повышение эффективности использования и развитие ресурсного потенциала рыбохозяйственного комплекса в 2009 - 2013 годах», утвержденной постановлением Правительства Российской Федерации от 12 августа 2008 г. N 606, а также в реализации Федеральной целевой программы «Мировой океан» (подпрограмма: «Освоение Арктики»), утвержденной постановлением Правительства Российской Федерации № 731 от 30.09.2008.

ФГУП «Нацрыбресурс» осуществляет свою деятельность за счет средств, получаемых им за выполнение работ (услуг), связанных с комплексным обслуживанием судов рыбопромыслового флота в рыбных терминалах морских портов, сдачи в аренду закрепленного за Предприятием имущества и иных доходов от осуществляемой деятельности.

В настоящий момент ФГУП «Нацрыбресурс» осуществляет следующие виды деятельности:

· Эксплуатация находящегося в хозяйственном ведении промыслового, транспортного и научно-исследовательского флота;

· Эксплуатация находящихся в хозяйственном ведении гидротехнических сооружений (причалы, пирсы, и.т.д) и портового флота;

· Организация и участие в исследованиях сырьевой базы рыболовства в водах, находящихся во владении и под юрисдикцией Российской Федерации, в зонах иностранных государств и открытой части Мирового океана;

· Издание отраслевых журналов «Вопросы рыболовства» и «Рыбное хозяйство»;

· Международное сотрудничество по поручениям Федерального агентства по рыболовству в сфере деятельности ФГУП «Нацрыбресурс»;

· Оптовая реализация рыбопродукции и морепродуктов.

В хозяйственном ведении ФГУП «Нацрыбресурс» находится павильон № 38 «Рыболовство» на территории Всероссийского Выставочного центра.

ФГУП «Нацрыбресурс» имеет сеть из 11 филиалов в портовых городах Северного, Дальневосточного и Южного бассейна.

Сегодня на Предприятии работают сотрудники, имеющие богатый профессиональный опыт, как в государственных, так и в коммерческих организациях. С 2008 года на предприятии выстраивается рыночная схема управления, проводится повышение эффективности деятельности всех подразделений, внедрение современных методов рыночного менеджмента.